• Административный секретариат
• Братство православных следопытов
• Дисциплинарно-каноническая комиссия
• Древлехранитель
• Комиссия по канонизации святых
• Комиссия по делам пастырского и приходского служения
• Межконфессиональный совет Крыма
• Межъепархиальные коллегии
• Миссионерский отдел
• Отдел по делам молодежи
• Отдел по взаимодействию с Вооруженными Силами
• Отдел религиозного образования и катехизации
• Паломнический отдел
• По делам семьи
• Пресс-служба
• Отдел социального служения
• Отдел по физической культуре и спорту
• Юридический отдел
• Служба протокола
• Специальный гуманитарный центр Крымской митрополии
• Хозяйственный отдел